Le directory sono dei cataloghi di siti organizzati per categorie e sottocategorie, compilati da uno staff editoriale. Le più usate sono quella di Yahoo! a livello mondiale, e quella di Virgilio in Italia. Quando si inseriscono delle parole chiave in Yahoo! o Virgilio, i risultati derivano da una ricerca nelle rispettive directory, e solo se non trovano riscontri per le parole chiave digitate, cercano nel web (entrambi tramite Google).

La sproporzione fra il numero dei siti segnalati e le risorse umane necessarie per la catalogazione ha spinto Yahoo! a introdurre una tassa per l'inclusione, di 299 dollari l'anno. Vengono presi in considerazione solo siti in lingua inglese che presentano determinate caratteristiche, e il pagamento della tassa non garantisce un posizionamento preferenziale.

Diversamente dal pay per inclusion dei motori di ricerca, che non esclude l'indicizzazione libera eseguita in modo automatico, in Yahoo! si entra solo pagando (fanno eccezione i siti non-profit).

Simile è la politica adottata dalla directory di Looksmart, integrata nei risultati delle ricerche di Msn e nei canali di Altavista ed Excite. A differenza di Yahoo!, Looksmart ha tariffe differenziate a seconda della velocità di inserimento dei siti segnalati (299$ express, 149$ basic).